В 2014 году на момент захвата штаба флота он исполнял обязанности начальника штаба ВМС. И его заданием было тогда – вывезти штаб флота из Крыма. Сам он с колонной офицеров на личном автомобиле выезжал из Крыма 10 апреля 2014 года. Алексей Неижпапа уверяет, что высшее военно-политическое руководство Украины еще в 2013 году знало, что готовит Россия в Украине.